ElektroIndonesia.Com
Selasa, 17 Juli 2018
-- Komputer
  Julukan Super Komputer Tercepat Sejagad Kini Milik China
  ME310 Hasilkan Konsep Laptop Dengan Desain Ramah Lingkungan
  Anton Supercomputer - Mesin simulasi gerakan protein dengan besaran milidetik
  Intel Kembangkan Komputer Pembaca Pikiran
  Perancangan Aplikasi Persedian Barang pada Personal Digital Assistant (PDA) dengan Menggunakan NS-Basic
-- Komunikasi
  Musik dan Warna Bisa Cerdaskan Anak
  Menelepon Kini Bisa Dilakukan via Gmail
  Pengenalan untuk Next Generation Networks
  Elemen Perancangan Sistem Kabel Coaxial pada pada Jaringan HFC
   Perencanaan Daya Pancar BTS untuk Sistem GSM pada Jalur Kereta Api Jakarta-Bandung
-- Kontrol/Kendali
  Turbin Angin Masa Depan Harus Mampu Terbang
  Sebuah pengalaman dalam upaya mewujudkan capacity building di bidang Sistem Instrumentasi dan Kendali reaktor nuklir
  Sebuah pengalaman dalam upaya mewujudkan capacity building di bidang Sistem Instrumentasi dan Kendali reaktor nuklir
  Pengaturan Lampu Lalulintas Berbasis Fuzzy Logic
  Pengaturan Lampu Lalulintas Berbasis Fuzzy Logic
Anton Supercomputer - Mesin simulasi gerakan protein dengan besaran milidetik
2010-10-19

Protein Dinamika: Mesin mensimulasikan gerakan protein milidetik-besaran, tetapi beberapa sistem catatan memiliki keterbatasan

Superkomputer Anton kini online dan siap untuk melipat protein. DE Shaw Research, yang dirancang dan dibangun Anton paralel secara besar-besaran, akhirnya telah diverifikasi.

Komputer dilakukan dua jenis simulasi sistem yang sudah dipelajari: Pada pertama, simulasi Anton 100-mikrodetik dari FiP35 protein domain menunjukkan bahwa domain lipatan dan terbentang dalam perkembangan yang sama setiap kali-langkah mengejutkan beberapa peneliti. Simulasi kedua melibatkan sebuah studi, lagi satu milidetik dari dinamika inhibitor protein sudah dilipat tripsin pankreas sapi (BPTI), yang mengeksplorasi gerakan rumit protein dalam air. Hasil diterbitkan di Science (2010, 330, 341).

"Karya ini menunjukkan bahwa mesin mereka benar-benar dapat melakukan tugas-tugas yang mereka usulkan," ujar Vijay Pande, seorang profesor kimia asosiasi di Stanford University dan pembuat lipat @ proyek rumah, yang memanfaatkan komputer rumah relawan 'untuk melakukan perhitungan protein komputasi secara intensif.

Anton dibangun semata-mata untuk tujuan dinamika molekul (MD) simulasi perilaku dari molekul-molekul biologis yang besar. Mesin, yang menyelesaikan lebih dari setahun yang lalu, taruhannya klaimnya menjadi terkenal pada kemampuannya untuk melakukan simulasi panjang yang tidak mungkin dilakukan di superkomputer saat ini. Hasil baru menandai uji signifikan pertama kecakapan Anton.

MD simulasi, yang melacak gerakan setiap atom dalam molekul besar, terbatas dalam skala waktu mereka dengan kekuatan komputer dan arsitektur. Hal ini dapat mencapai bulanan, sebuah sistem superkomputer untuk mensimulasikan hanya puluhan mikrodetik dinamika protein's. Tapi banyak protein lipat pada skala waktu milidetik.

Anton, penciptanya melaporkan, ia mampu melakukan simulasi milidetik-panjang sistem yang mengandung puluhan ribu atom dalam 100-hari 100 kali lebih cepat dibandingkan dengan superkomputer saat ini.

David E. Shaw, kepala ilmuwan di Shaw Research, menceritakan C & EN bahwa Anton sekarang mensimulasikan protein dengan perilaku lipat lebih rumit. "Kami sekarang memiliki beberapa hasil awal menggembirakan pada lipat protein tertentu yang dikenal lipat lebih lambat daripada yang diteliti dalam kertas Science," katanya.

Baru-baru ini, Shaw Penelitian menyumbangkan komputer lain Anton ke Pittsburgh Supercomputing Center untuk digunakan penelitian oleh universitas-universitas dan lembaga nirlaba lainnya melalui Sumber Daya Nasional untuk Biomedis Supercomputing.

Kelompok Schulten merupakan salah satu dari 45 yang diberikan waktu pada mesin oleh National Science Foundation. Kelompoknya mulai simulasi minggu lalu, dan "itu bekerja sangat baik," katanya.

Oleh : admin
Sumber : pubs.acs.org

Artikel Terkini :
Elektro --
Sensor CO2 baru yang sederhana  
Operasional Seluler Habiskan 70 Juta Liter Solar  
Teknologi Prosesor Berbasis Molekul DNA  
Penyisipan Informasi Data Digital Pada Siaran AM  
Perancangan Layout IC CMOS Multivibrator Monostabil Menggunakan Program LASI  
Energi --
Scenedesmus, Sumber Bahan Bakar Bio Sekaligus Penetralisir Air Limbah  
21,3 GigaWatt Energi Bersih Dari Hancurnya Ekosistem di hasilkan Cina  
Selangkah Lagi Bensin Sintetis Tanpa Emisi Karbon Siap Gantikan Bensin Berbasis Minyak Bumi  
Baterai Lithium Ion Yang ''Terinfeksi'' Virus, Menyimpan Energi 10 Kali Lebih Banyak  
Cina Akan Bangun Pembangkit Listrik BioGas Terbesar Pertama di Dunia  
Instrumentasi --
BMW Siap Produksi Mobil Ramah Lingkungan Seri i3 dan i8  
Lemari Pendingin Tanpa Listrik Pertahankan Suhu Selama 10 Hari  
Baju Pengganti Baterai  
Seoul Akan Operasikan Bis Listrik di Rute Komersial  
Honda Luncurkan Program Untuk Mengenali Berbagai Aspek Dalam Teknologi Mobil Listrik  
Komputer    Komunikasi    Kontrol    Elektro    Energi    Instrumentasi
Copyright © 2006